More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  100 
 
 		 267 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1433  IclR family transcriptional regulator  63.49 
 
 		 255 aa  347  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  62.85 
 
 		 260 aa  338  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 252 aa  309  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  59.51 
 
 		 257 aa  305  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0296  transcriptional regulator IclR-like protein  46.15 
 
 		 252 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0905  IclR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.447729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1512  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.388908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 272 aa  221  7e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  39.44 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  39.58 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  38.08 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  38.24 
 
 		 250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  36.18 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 299 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  35.27 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  35.92 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  33.18 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1070  regulatory proteins, IclR  38.02 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.93 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  27.6 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  29.48 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.72 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.51 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  24.8 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 550 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  28.44 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.89 
 
 		 254 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.16 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  29.46 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  27.95 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 261 aa  92.4  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  25.61 
 
 		 252 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.75 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.98 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 308 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>