More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0713 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0713  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7131  IclR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1941  IclR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383079  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0194  transcriptional regulator, IclR family  35.1 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0903072  decreased coverage  0.000072825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0203  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  33.48 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.34 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.09 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.08 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  30.08 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  30.08 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  30.08 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  30.08 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  30.08 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.08 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  30.22 
 
 		 255 aa  92.8  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.27 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.98 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.77 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  24.07 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.35 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  29.07 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  30.67 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  30.67 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  30.67 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  30.67 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  30.67 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.4 
 
 		 278 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 293 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 272 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.15 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  26.15 
 
 		 250 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 258 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 250 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  25.31 
 
 		 246 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  27.68 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.58 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  27.31 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  24.7 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2939  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  24.3 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3701  transcriptional regulator, IclR family  25.58 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  26.44 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.45 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  29.73 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  30.77 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  29.12 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  24.78 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.77 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1334  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>