More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1796 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1626  IclR-type transcriptional regulator  38.11 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 271 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  32.56 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 290 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.23 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 268 aa  85.5  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25.82 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  24.77 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.05 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  27.09 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  27.76 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  25.23 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  24.11 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.38 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.12 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.38 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  24.37 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.38 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.03 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 550 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  28.21 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  24.36 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  24.58 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5059  transcriptional regulator IclR-like protein  28.63 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.487025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.77 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.34 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  26.4 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  23.62 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  25.69 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  30.38 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.4 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.4 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.4 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.4 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.4 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  23.4 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  27.35 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  30 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  26.05 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  22.12 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  26.05 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  27.18 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  27.17 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.24 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  21.9 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  25 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.4 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.63 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  25.81 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>