More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1626 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1626  IclR-type transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  500  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  34.02 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.24 
 
 		 295 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 282 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  31.42 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  27.88 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  30.88 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  32.85 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 271 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 284 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.13 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  29.49 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5019  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.42 
 
 		 252 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 550 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 272 aa  85.9  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  24.19 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5091  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.1 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  24.19 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.38 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  23.61 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  25 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  27.27 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  20.87 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  27.16 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.26 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  24.19 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  23.72 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  30.5 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  23.91 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.54 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  29.17 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  28.15 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  27.15 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.49 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  23.91 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  24.29 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  26.91 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  26.85 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  23.66 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  24.88 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  27.14 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  24.6 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  29.51 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  26.51 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  27.7 
 
 		 281 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>