More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2270 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
269 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
271 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
246 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
276 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  34.92 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 
265 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
269 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 
256 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 
287 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1626  IclR-type transcriptional regulator  34.02 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.74 
 
 
246 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
246 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.3 
 
 
280 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  29.44 
 
 
271 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 
271 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.44 
 
 
271 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.44 
 
 
271 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.44 
 
 
271 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  29.44 
 
 
271 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  33.18 
 
 
299 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
282 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.44 
 
 
256 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.44 
 
 
256 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.44 
 
 
271 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.97 
 
 
254 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.56 
 
 
295 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.05 
 
 
272 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 
256 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.05 
 
 
272 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.05 
 
 
272 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.05 
 
 
272 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 
252 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 
247 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
250 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
267 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
249 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
249 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  26.53 
 
 
251 aa  102  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  27 
 
 
280 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  27 
 
 
280 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  27 
 
 
280 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 
250 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.49 
 
 
258 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  28.93 
 
 
250 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  27.67 
 
 
278 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
250 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.29 
 
 
276 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.42 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.42 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.42 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.42 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.42 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.42 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.42 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  34.05 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  34.72 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
291 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  27.89 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.17 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.58 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.91 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  32.17 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  33.49 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  29.02 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  32.61 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.13 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 
254 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1625  IclR-type transcriptional regulator  29.77 
 
 
277 aa  94  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
286 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.34 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  28.32 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.79 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.79 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.79 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.79 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.79 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  30.15 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  29.73 
 
 
276 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
259 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>