More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2636 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  99.62 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  98.46 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  98.46 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  98.07 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  86.92 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  86.92 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  86.92 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  86.54 
 
 		 260 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  86.92 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  86.54 
 
 		 260 aa  460  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  86.92 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3913  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 268 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 280 aa  128  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.56 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.24 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.74 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  35.07 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.06 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  27.45 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3701  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  30.33 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  32.56 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  32.56 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  28.89 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 251 aa  111  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.69 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.8 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.67 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  31.67 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  31.67 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  31.67 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  31.67 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  31.67 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  31.67 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.86 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.22 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.22 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.22 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.22 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.22 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  29.07 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.55 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.78 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.08 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.08 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.08 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.1 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  34.72 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  29.55 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 317 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 263 aa  99  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>