More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2285 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 276 aa  216  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  45.75 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  40.34 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  40.98 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  34.96 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  34.56 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  34.02 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  35.74 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  35.74 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  35.74 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  34.85 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0687  regulatory proteins, IclR  34.75 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  33.05 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  30.04 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  29.63 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  29.63 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  34.72 
 
 		 215 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.64 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  32.26 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  33.64 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  32.73 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  30.95 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  28.93 
 
 		 286 aa  98.6  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  32.72 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  28.97 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  30.52 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  32.97 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  27.57 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30.22 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>