More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0687 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0687  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.35 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.65 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  30.04 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  35.98 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.51 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3937  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.69 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  24.23 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  34.5 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  24.7 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1638  transcriptional regulator IclR-like protein  32.11 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318022  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  27.66 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.9 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  28.03 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.57 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.29 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  37.01 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  25.1 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  29.67 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  28.71 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4926  transcriptional regulator IclR-like protein  41.76 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0909011  normal  0.863129 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  29.11 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  25.1 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  25.1 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  27.8 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  47.13 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  47.13 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  32.09 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3996  IclR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  45.98 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  24.71 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.24 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0127  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  22.47 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  27.05 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  45.98 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  45.98 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>