More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1595 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  68.75 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  68.62 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  58.61 
 
 		 249 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 249 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  61.25 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  58.2 
 
 		 247 aa  258  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  51.37 
 
 		 244 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  45.34 
 
 		 242 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  44.54 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  32.46 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  32.46 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  33.04 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  28.69 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  28.46 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  31.36 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  32.87 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  32.87 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  29.68 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.75 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  27.31 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.89 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  31.37 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  29.68 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  27.52 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  29.66 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2412  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  30.45 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  25.99 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  28.51 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0194  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0903072  decreased coverage  0.000072825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  27.48 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.36 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  32 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>