More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2412 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2412  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 257 aa  93.2  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.54 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 252 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  25.33 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.88 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.46 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.46 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  29.46 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.46 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.46 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.46 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  29.46 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  28.14 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  29.76 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  27.14 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  26.99 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  30.73 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.18 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.18 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.18 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2930  regulatory proteins, IclR  28.15 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.17 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.05 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.85 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  26.78 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  27.5 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  23.56 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  27.85 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  28.38 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3673  transcriptional regulator, IclR family  28.89 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.146603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.35 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  26.11 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  29.46 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.61 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.61 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.61 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.61 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.61 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.61 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.61 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  28.76 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  29.83 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  22.47 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  25.61 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  26.16 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  27.66 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>