More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4808 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  98.17 
 
 		 273 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  88.81 
 
 		 272 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  88.81 
 
 		 272 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  88.81 
 
 		 272 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  71 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  44.44 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  44.44 
 
 		 264 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  43.58 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  40.44 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 234 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  42.08 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 250 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 242 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  40.76 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  39.11 
 
 		 334 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  38.43 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 236 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 236 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  36.53 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  36.28 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  36.99 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  35.71 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  34.42 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  34.42 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  36.07 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  36.53 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  33.76 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  35.65 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  39.25 
 
 		 233 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  34.26 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  34.26 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  35.94 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  34.1 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  34.07 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  34.56 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 220 aa  92  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  32.71 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  34.56 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  34.7 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 283 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 228 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  33.48 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  28.05 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.63 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  26.84 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1452  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.378488  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  31.28 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  24.09 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>