More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4012 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  65.71 
 
 		 264 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  65.71 
 
 		 264 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  44.69 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 266 aa  181  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  47.91 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  43.4 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  42.13 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  40.25 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  35.15 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  32.24 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  32.24 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  32.71 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 277 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  31.78 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  27.57 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  31.51 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  32.46 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  30.52 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  30.64 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  26.91 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  27.92 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  29.73 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  36.6 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  30.19 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  27.05 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  31.66 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  27.38 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  23.85 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2399  regulatory protein, IclR  29.15 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  28.51 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4164  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000832407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  30.84 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  26.81 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>