More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3208 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  37.61 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  34.92 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2721  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6316  IclR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4095  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267726  normal  0.126686 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3982  transcriptional regulator, IclR family  33.49 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4142  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8325  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4617  IclR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5624  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6026  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.221801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5399  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  decreased coverage  0.00269642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5463  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4871  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  33.82 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4707  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  33.82 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  34.31 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  32.19 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  28 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  32.57 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  33.82 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1830  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135773  normal  0.345416 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  28.86 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  32.35 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  29.11 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  30.73 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  33.15 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  26.35 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  28.5 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  26.92 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  24.48 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  24.48 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.48 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.48 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.48 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  24.48 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  24.48 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.23 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1081  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199562  normal  0.251697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  30.2 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.23 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  29.75 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.92 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.73 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.73 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4432  IclR family transcriptional regulator family  26.19 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.73 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.73 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.87 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>