More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3331 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  39.07 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  34.29 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0993  IclR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.892724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3613  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  34.36 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.52 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  33.83 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  35.64 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  23.85 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  27.52 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  27.52 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  31.6 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  23.77 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 259 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  23.81 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  27.85 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  26.39 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  28.7 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2967  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  25.76 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  26.91 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  25.11 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  29.83 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3937  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  24.11 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  25.58 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  23.72 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  28.14 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  24.19 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  22.13 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  23.72 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  23.62 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  26.4 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  26.4 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  26.4 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  26.4 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  26.4 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  25.69 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1042  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00956933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  25.81 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2360  regulatory proteins, IclR  24.75 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  27.62 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  27.91 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>