More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7315 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  58.89 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  52.51 
 
 		 567 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  37.05 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  36.21 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  38.17 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  39.84 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  37.83 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  33.2 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  36.77 
 
 		 288 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  35.78 
 
 		 635 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  37.44 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  35.42 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  32.16 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  36.78 
 
 		 274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  36.63 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  32.28 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  36.79 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  37.6 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  31.25 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  33.8 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  28.4 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 291 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  31.02 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  31.02 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  34 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  31.54 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.54 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  37.62 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  30.58 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>