More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6484 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  41.67 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  35.98 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0993  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.892724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3613  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 317 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  32.79 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  32.2 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.39 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  30.09 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  27.97 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 258 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 267 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  25.23 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2760  regulatory protein IclR  24.88 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.39 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  28.72 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2380  IclR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  25.63 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  21.98 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  24.88 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  26.4 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  24.75 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  25.59 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  23.72 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3802  IclR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1436  IclR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.580243 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1079  IclR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.160776  normal  0.539757 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  24.51 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  24.54 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4232  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  24.07 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1546  IclR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00070993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  24.07 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  23.79 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4269  IclR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0275811  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5965  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  24.39 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  25.37 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  25.12 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  23.26 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  22.22 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1052  transcriptional regulator, IclR family  25.63 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  24.02 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  24.89 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  22.58 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4390  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  25.25 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  22.57 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4414  transcriptional regulator, IclR family  24.54 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3977  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259403  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4304  transcriptional regulator, IclR family  24.54 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1595  IclR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1629  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.632247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  21.56 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  23.72 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  24 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>