287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0473 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0473  regulatory protein IclR  100 
 
 		 244 aa  510  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3331  IclR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6484  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6719  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182238  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7431  Transcriptional regulator  35.12 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0993  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.892724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5810  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3441  regulatory proteins, IclR  26.79 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3613  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0340  IclR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.151352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0615  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  26.42 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5598  Transcriptional regulator  28.22 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0201808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3795  IclR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  25.79 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  25.93 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0105  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  29.56 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  26.91 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  24.38 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  27.35 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  22.27 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  26.92 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  19.53 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  23.53 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  26.92 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  22.69 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0091  transcriptional regulator, IclR family  26.04 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  23.04 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3045  transcriptional regulator IclR  25.53 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  22.58 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  26.01 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0118  IclR family transcriptional regulator  24 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  21.9 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25.1 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6121  transcriptional regulator IclR family  25.1 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  20.64 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  23.11 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  22.58 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  21.32 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3717  IclR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0598808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3497  IclR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5397  transcriptional regulator, IclR family  25.48 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1052  transcriptional regulator, IclR family  22.94 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  22.98 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  21.4 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  20 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  24.15 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  23.61 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  21.95 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  20.66 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  20 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  22.37 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5311  regulatory protein, IclR  22.45 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  23.85 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  20.98 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  22.31 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1626  IclR-type transcriptional regulator  22.32 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  22.86 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  22.67 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  23.27 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  23.08 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  22.61 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  20.97 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  21.93 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  23.48 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  23.17 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 269 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>