More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6267 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3621  transcriptional regulator, IclR family  62.99 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.670141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  63.64 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1420  transcriptional regulator, IclR family  59.46 
 
 		 269 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.956914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  65.18 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  51.76 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  57.27 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  53.33 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04160  transcriptional regulator, IclR family  52.23 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0647577 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  48.39 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30720  transcriptional regulator  53.21 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  38.2 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.45 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 285 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  29.64 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.78 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.88 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  33.78 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4192  transcriptional regulator, IclR family  39.73 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4080  transcriptional regulator, IclR family  39.73 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 298 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  35.43 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.37 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  35.57 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.96 
 
 		 280 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  33.18 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.37 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.79 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.18 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  32.58 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.62 
 
 		 277 aa  99.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  31.14 
 
 		 324 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  32.13 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.57 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.57 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>