More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4713 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  99.33 
 
 		 298 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  96.64 
 
 		 297 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  95.88 
 
 		 314 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  95.53 
 
 		 314 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  93.81 
 
 		 310 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  91.94 
 
 		 316 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 		 316 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 		 316 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 		 316 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 		 316 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  90.84 
 
 		 316 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 		 316 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 		 316 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  76.43 
 
 		 324 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  77 
 
 		 324 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  77.45 
 
 		 318 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 294 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  65.28 
 
 		 294 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 286 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  66.92 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  64.6 
 
 		 285 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 284 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 285 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 285 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 285 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 285 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  65.78 
 
 		 284 aa  341  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 285 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  55.64 
 
 		 279 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  53.73 
 
 		 275 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  53.73 
 
 		 275 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  54.75 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 295 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 274 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  52.08 
 
 		 278 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 278 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 268 aa  182  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 261 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  37.33 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  33.78 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.11 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.35 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 260 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 260 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 268 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.18 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  34.39 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.62 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  31.37 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  34.93 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  28.24 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.9 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.9 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 256 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 294 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>