More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7055 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 324 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  94.43 
 
 		 324 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  77.99 
 
 		 318 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  73.2 
 
 		 314 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  72.88 
 
 		 314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  76.43 
 
 		 298 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  76.43 
 
 		 298 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  76.77 
 
 		 298 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  76.9 
 
 		 310 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  78.8 
 
 		 297 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  77.32 
 
 		 316 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  76.58 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  76.58 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  76.58 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  76.58 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  76.58 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  76.58 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  76.58 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  65.23 
 
 		 294 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  65.23 
 
 		 294 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  70.61 
 
 		 286 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 285 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 285 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 285 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 285 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  65.41 
 
 		 285 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  63.9 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  65.06 
 
 		 284 aa  348  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 284 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 284 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 284 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 284 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 284 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 284 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 284 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 284 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 279 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  57.87 
 
 		 275 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  57.87 
 
 		 275 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 278 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  54.83 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  52.22 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 268 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 261 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  38.96 
 
 		 264 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 254 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 271 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.78 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  33.93 
 
 		 267 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 267 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  29.53 
 
 		 260 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  29.53 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 294 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 260 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.3 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  35.38 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 267 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  33.94 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.48 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.2 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.2 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 261 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.2 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  32.24 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.2 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  29.08 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  29.53 
 
 		 265 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 601 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>