More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0754 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 275 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  74.36 
 
 		 291 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  41.3 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  39.54 
 
 		 260 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  41.46 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  37.5 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  39.44 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  35.89 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  36.3 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  38.02 
 
 		 635 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 288 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  36.86 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  36.86 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  35.88 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  35.18 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 267 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  36.65 
 
 		 280 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 265 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  34.66 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1166  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  33.86 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5157  IclR family transcriptional regulator family  32.02 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  31.35 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  32.06 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 567 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  28.96 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  34.83 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  33.06 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 328 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  29.13 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  27.91 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  28.51 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  33 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.43 
 
 		 278 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  33.33 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  29.78 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  32.52 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  30.91 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  37.59 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  27.27 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>