More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0707 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  99.64 
 
 		 275 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  86.81 
 
 		 273 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  64.23 
 
 		 274 aa  324  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  66.81 
 
 		 267 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 263 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  50.19 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  51 
 
 		 263 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  51 
 
 		 263 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  51 
 
 		 263 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 263 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  51 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 263 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  40.7 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 268 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  36.92 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  39.61 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 292 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  38.28 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  36.67 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  37.4 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  36.19 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  37.05 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  37.5 
 
 		 635 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  36.23 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 273 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  35.87 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  38.98 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  36 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  34.87 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  35.74 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  34.43 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  36.97 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  34.42 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  35.25 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  39.2 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  37.26 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 211 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  35.32 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1166  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 567 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  32.28 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  32.28 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  33.66 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0814  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.91891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>