More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3981 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  100 
 
 		 280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  74.05 
 
 		 309 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  41.43 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 284 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  36.61 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  39.18 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  38.61 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  36.25 
 
 		 283 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  36.21 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  35.66 
 
 		 267 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  35.66 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  35.25 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  37.23 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  36.92 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  33.98 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  38.67 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  35.06 
 
 		 635 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  35.5 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 322 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  29.84 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  36.44 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 567 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  36.26 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  31.87 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  31.97 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>