More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7143 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  63.76 
 
 
289 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  56.54 
 
 
567 aa  308  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
289 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  36.5 
 
 
265 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
284 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
284 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  36.76 
 
 
309 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
268 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  36.13 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  35.48 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 
312 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
292 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 
288 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
284 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
288 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  36.74 
 
 
313 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
263 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
274 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  32.53 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
267 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 
261 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
267 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
267 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
263 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
267 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
312 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 
267 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
267 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 
272 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  36.14 
 
 
271 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  32.93 
 
 
268 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
263 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 
280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  32.78 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
268 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
260 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  31.34 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
275 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
275 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
275 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
268 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
267 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  36.68 
 
 
273 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 
274 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  36.09 
 
 
275 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
260 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
274 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 
274 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 
261 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
274 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
278 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  32.8 
 
 
635 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 
254 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  35.92 
 
 
268 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
274 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
278 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
277 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
230 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 
259 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
262 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
270 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
260 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  33.7 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.55 
 
 
278 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  31.19 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  29.04 
 
 
267 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  28.29 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>