More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1818 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  57.65 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  50.61 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  51.21 
 
 		 635 aa  235  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  49.4 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  40.7 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  41.37 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  37.4 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 263 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 284 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 281 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  34.23 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  40.07 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  35.46 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  36.02 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  40.35 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  40.35 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  41.82 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  34.12 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  33.46 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  32.8 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  35.84 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  31.27 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 260 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  38.61 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  30.16 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5157  IclR family transcriptional regulator family  30.6 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  32.42 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  33.02 
 
 		 254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1166  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 567 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  34 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0804  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  25.94 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0814  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.91891 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  25.6 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 278 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 290 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  26.21 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.41 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 275 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>