More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
288 aa  590  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  93.75 
 
 
284 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  70.08 
 
 
284 aa  377  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  70.08 
 
 
284 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  58.15 
 
 
281 aa  350  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  58.69 
 
 
281 aa  345  6e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  51.38 
 
 
268 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  49.8 
 
 
265 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  48.39 
 
 
288 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
292 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
292 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  45.45 
 
 
283 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  48.56 
 
 
273 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
281 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  42.51 
 
 
309 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  41.83 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
260 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
284 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  41.29 
 
 
280 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 
267 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  39.76 
 
 
267 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  42.51 
 
 
313 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
272 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
274 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  41.2 
 
 
261 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
263 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  38.35 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
312 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
267 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
267 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
267 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
267 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
267 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  38.91 
 
 
268 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
289 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
263 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
263 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
263 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
263 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
263 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  38.49 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  39.45 
 
 
274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
263 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
274 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
275 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
275 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
275 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  37.34 
 
 
306 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
274 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
278 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
274 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
274 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  38.03 
 
 
280 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
267 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  35.16 
 
 
261 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 
260 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
274 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
230 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  34.27 
 
 
262 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 
262 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  37.21 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5157  IclR family transcriptional regulator family  34.26 
 
 
270 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  33.47 
 
 
274 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 
275 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 
274 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
275 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  35.06 
 
 
635 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 
291 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
289 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  44.05 
 
 
211 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  35.89 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  35.86 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
290 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  41.83 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1166  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  29.63 
 
 
315 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
567 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
262 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
323 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0804  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
275 aa  123  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  34.72 
 
 
271 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
268 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
260 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0814  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.91891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 
321 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
328 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  34.91 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>