More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1670 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5157  IclR family transcriptional regulator family  68.05 
 
 		 270 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 260 aa  325  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  60.23 
 
 		 262 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  59.85 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  37.3 
 
 		 283 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  34.22 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  34.52 
 
 		 265 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  32.66 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  34.46 
 
 		 635 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  34.12 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  30.58 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  30.86 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  32.05 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  30.74 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 312 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  31.97 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  28.95 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  28.4 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  30.23 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1166  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 288 aa  99  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 267 aa  95.5  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 268 aa  95.5  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  30.37 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 211 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  31.58 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  31.03 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 567 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  28.23 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  28.43 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>