More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1166 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1166  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  50.79 
 
 		 268 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  48.02 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  37.76 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  37.76 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  32.11 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  33.61 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  34.52 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  30.17 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  30.58 
 
 		 309 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  33.06 
 
 		 635 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  28.25 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  29.62 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 274 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  30.31 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  27.27 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5157  IclR family transcriptional regulator family  26.23 
 
 		 270 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  29.41 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  31.03 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  30.13 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  24.69 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  23.97 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  23.87 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  23.87 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  28.09 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 567 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  27.45 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  28.93 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 211 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  26.05 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>