More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0691 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
260 aa  530  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  70.38 
 
 
262 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  70.38 
 
 
262 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  60.16 
 
 
274 aa  325  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5157  IclR family transcriptional regulator family  61.26 
 
 
270 aa  322  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  38.31 
 
 
283 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
260 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  33.06 
 
 
265 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
288 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
284 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 
260 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
284 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
291 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
264 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  31.08 
 
 
635 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 
280 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  31.5 
 
 
259 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  30.13 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  30.56 
 
 
309 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
281 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
263 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
267 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
281 aa  113  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 
288 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 
261 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  29.55 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
292 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
292 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
263 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  27.98 
 
 
270 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 
321 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 
274 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
262 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
277 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  30.15 
 
 
313 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
278 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  29.24 
 
 
280 aa  99  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  27.16 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  27.02 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 
312 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
328 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
322 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
270 aa  92  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  30.65 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
274 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  33.66 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1166  IclR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 
275 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 
274 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  27.89 
 
 
315 aa  82  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
211 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
567 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  26.03 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0804  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>