More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1199 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  99.27 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  94.14 
 
 		 274 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  92.25 
 
 		 274 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  81.78 
 
 		 306 aa  427  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  82.1 
 
 		 275 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  82.1 
 
 		 275 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  82.1 
 
 		 275 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  73.88 
 
 		 278 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  94.01 
 
 		 230 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  73.06 
 
 		 274 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  70.85 
 
 		 278 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  98.41 
 
 		 211 aa  358  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1787  transcriptional regulator, putative  90.32 
 
 		 180 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000180393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  48.79 
 
 		 261 aa  245  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  40.89 
 
 		 280 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  42.91 
 
 		 313 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  37.84 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  41.7 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  38.04 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  35.46 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 291 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  35.69 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  37.13 
 
 		 280 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  36.09 
 
 		 274 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  36.43 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  36.43 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  31.12 
 
 		 267 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  36.9 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  34.02 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  35.55 
 
 		 271 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  32.56 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  31.02 
 
 		 635 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  32.63 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 567 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  32.04 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  31.55 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  29.18 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  29.09 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 315 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  34.27 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 267 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  29.72 
 
 		 251 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  34.07 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0814  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.91891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  28.86 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 323 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>