More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1366 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
275 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
275 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
275 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  97.82 
 
 
306 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  83.72 
 
 
274 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  82.1 
 
 
274 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  81.71 
 
 
274 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  81.71 
 
 
274 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  81.78 
 
 
274 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  72.18 
 
 
278 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  72.27 
 
 
274 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  68.91 
 
 
278 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  85.1 
 
 
230 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1787  transcriptional regulator, putative  98.19 
 
 
180 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000180393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  87.57 
 
 
211 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  46.77 
 
 
261 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 
280 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  39.92 
 
 
313 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  39 
 
 
284 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  36.98 
 
 
292 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
288 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  38.84 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  35.97 
 
 
288 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  39.52 
 
 
312 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
284 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
284 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  35.48 
 
 
265 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
284 aa  149  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  36.29 
 
 
309 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
281 aa  142  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
281 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
281 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  35.44 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
273 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  34.23 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
289 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
274 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  30.67 
 
 
267 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  35.48 
 
 
271 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
277 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 
267 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
268 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
274 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
272 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
283 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
263 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  34.52 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
262 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
290 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
263 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  32.42 
 
 
315 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  30.34 
 
 
635 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
263 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
263 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
263 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
263 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
263 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
328 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  30.37 
 
 
321 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  33.21 
 
 
274 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  31.71 
 
 
262 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
322 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 
262 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  29.77 
 
 
266 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
567 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  31.98 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
268 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0804  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  31.75 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  30.69 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 
259 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  28.63 
 
 
251 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0814  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
275 aa  89  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.91891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  32.69 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5157  IclR family transcriptional regulator family  30.15 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>