More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1081 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  94.89 
 
 		 274 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  92.99 
 
 		 274 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  92.25 
 
 		 274 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  91.88 
 
 		 274 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  98.64 
 
 		 230 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  81.78 
 
 		 275 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  81.78 
 
 		 275 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  81.78 
 
 		 275 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  81.32 
 
 		 306 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  72.8 
 
 		 274 aa  390  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  71.27 
 
 		 278 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  70.88 
 
 		 278 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  94.71 
 
 		 211 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1787  transcriptional regulator, putative  90.38 
 
 		 180 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000180393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  47.18 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  38.87 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  38.22 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  41.94 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  37.6 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  41.7 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 292 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  35.46 
 
 		 288 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  37.55 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  37.34 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  32.05 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  32.05 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  36.51 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  32.94 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  35.07 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  35 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  31.84 
 
 		 635 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 567 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  29.62 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  30.62 
 
 		 259 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  28.98 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  31.07 
 
 		 262 aa  95.5  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30.16 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 322 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 323 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  34.01 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  28.24 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  30.23 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  27.85 
 
 		 321 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0814  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.91891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  32.8 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>