More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1216 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  63.76 
 
 		 290 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  61.57 
 
 		 567 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  36.14 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  36.14 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  36.14 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  35.94 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  35.32 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  33.48 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  34.75 
 
 		 261 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 274 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  35.44 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 263 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  35.15 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  30.86 
 
 		 635 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 211 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 275 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 274 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  35.18 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  30.74 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  34.82 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  30.09 
 
 		 263 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  29.87 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1787  transcriptional regulator, putative  35.22 
 
 		 180 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000180393  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.52 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.27 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  29.27 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  29.27 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29.27 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  29.27 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  29.27 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.44 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>