More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5773 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 263 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 268 aa  295  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  57.79 
 
 		 254 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 262 aa  258  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  55.81 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  42.22 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  35.02 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  34.55 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4222  IclR family transcriptional regulator family  38.74 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 263 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  37.8 
 
 		 309 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  33.5 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  36.45 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  38.42 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 312 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  34.42 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  35.55 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 567 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  37.26 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  37.26 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 288 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 635 aa  95.5  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 289 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 292 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  95.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  37.74 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  33 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  30.14 
 
 		 315 aa  89  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  28.41 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  33.15 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  29.38 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  29.38 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  33.33 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  29.38 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  31.1 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  30.54 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  38.57 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>