More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3880 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  42.23 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 
292 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  41.2 
 
 
288 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 
259 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  41.34 
 
 
292 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
260 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  41.37 
 
 
264 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
268 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 
260 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  39.3 
 
 
284 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
288 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
281 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  36.68 
 
 
265 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
273 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  38.06 
 
 
309 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  36.8 
 
 
635 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
274 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 
261 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
263 aa  158  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
263 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
267 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
267 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
312 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
267 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
267 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
268 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
263 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 
291 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  36.25 
 
 
267 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  38.06 
 
 
267 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  36.25 
 
 
267 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
263 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
263 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
263 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  35.25 
 
 
280 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
263 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
267 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
274 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
263 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
284 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  37.05 
 
 
291 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  34.15 
 
 
270 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  32.66 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  36.29 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
277 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  37.21 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 
274 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  39.91 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  33.99 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  34.23 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  32.22 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
274 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  36.36 
 
 
268 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
274 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  30.86 
 
 
274 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
274 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  38.01 
 
 
313 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
274 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
260 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
265 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
290 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
262 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  31.85 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5157  IclR family transcriptional regulator family  31.46 
 
 
270 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1166  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
288 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  38.42 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
268 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
567 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
211 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
328 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  31.76 
 
 
315 aa  102  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  30.81 
 
 
315 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 
270 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
322 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
289 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>