More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3643 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  93.75 
 
 		 288 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  69.85 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  69.85 
 
 		 284 aa  371  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  58.3 
 
 		 281 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  50.6 
 
 		 265 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  48.79 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  46.25 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 273 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  43.72 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  39.76 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  42.4 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  41.94 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  41.73 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 272 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  39.71 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  42 
 
 		 261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 263 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  39.3 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  38 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  37.36 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 263 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  39 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  39 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  39 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  39.62 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  39.32 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  38.67 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 274 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 268 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 274 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  35.55 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  36.84 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  33.87 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  37.25 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  37.85 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 260 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5157  IclR family transcriptional regulator family  34.38 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  34 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  39.22 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  39.22 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  35.06 
 
 		 635 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  32.66 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  42.79 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1166  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2112  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 567 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3308  regulatory proteins, IclR  29.51 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3098  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374311  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3572  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  35.19 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3946  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0804  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0814  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.91891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>