More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7585 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
567 aa  1137    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  61.57 
 
 
289 aa  347  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  62.69 
 
 
270 aa  333  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7143  IclR family transcriptional regulator  56.54 
 
 
290 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396253  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  61.18 
 
 
260 aa  293  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  52.51 
 
 
262 aa  278  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
289 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  28.49 
 
 
635 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
268 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  35.22 
 
 
265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
284 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  37.56 
 
 
281 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 
267 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  32.67 
 
 
267 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
284 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
292 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  32.66 
 
 
309 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  29.62 
 
 
284 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
292 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
281 aa  124  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
274 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
292 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
288 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  34.58 
 
 
291 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 
283 aa  120  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
284 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  24.72 
 
 
281 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 
280 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
273 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 
261 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  31.11 
 
 
280 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
267 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
261 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
312 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
272 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
267 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
263 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
267 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
267 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
267 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
267 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 
291 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
274 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
274 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  35.98 
 
 
274 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
278 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  32.56 
 
 
312 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  36.41 
 
 
268 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  29.92 
 
 
268 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
274 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  32.52 
 
 
313 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
277 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
274 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
268 aa  105  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
274 aa  105  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
275 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
260 aa  104  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
262 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
278 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
263 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
274 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
263 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
263 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 
263 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
263 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
263 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
263 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
268 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
263 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
274 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
268 aa  99.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
275 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
275 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
275 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  29.28 
 
 
306 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
264 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  35.1 
 
 
274 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
263 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
263 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
263 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
230 aa  97.4  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 
259 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 
254 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
274 aa  96.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  32.51 
 
 
271 aa  95.5  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 
274 aa  95.1  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 
275 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 
269 aa  94.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
263 aa  94.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  32.03 
 
 
273 aa  94  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 
267 aa  94  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  34.23 
 
 
262 aa  92.8  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 
260 aa  92  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
268 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 
264 aa  91.3  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
265 aa  90.9  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
261 aa  90.1  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 
257 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>