More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7144 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  64.59 
 
 
270 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  60.73 
 
 
567 aa  298  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  53.31 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
264 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  33.88 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  33.61 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
292 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  34.86 
 
 
265 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
268 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
281 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
292 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  32.18 
 
 
635 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  33.48 
 
 
268 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
284 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 
259 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
284 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
274 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
292 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
268 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
267 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
260 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  32.07 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
263 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  29.77 
 
 
260 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
267 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
263 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
281 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
263 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
263 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
274 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
277 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  34.34 
 
 
312 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 
283 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  29.92 
 
 
264 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0622  transcriptional regulator, IclR family  28.71 
 
 
268 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.440212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 
291 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1670  regulatory protein, IclR  30.81 
 
 
274 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0894994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
262 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 
269 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
284 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  30.14 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  32.7 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  28.64 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  30.17 
 
 
313 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  29.41 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  26.72 
 
 
268 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
263 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  31.72 
 
 
274 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  27.24 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3915  transcriptional regulator  25.11 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504106  normal  0.604915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  30.35 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.35 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 
274 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  27.48 
 
 
267 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
291 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  30.47 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4070  IclR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
294 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
274 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
263 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
263 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.98 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>