More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1215 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  62.69 
 
 
567 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7144  IclR family transcriptional regulator  64.59 
 
 
260 aa  328  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563909  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  58.89 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
281 aa  146  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  36.49 
 
 
265 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  34.73 
 
 
309 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
281 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
268 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
268 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
292 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
284 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  33.06 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  34.04 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
277 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  35.86 
 
 
635 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  33.9 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
292 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
281 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
292 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 
288 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
268 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 
283 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
274 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
277 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
260 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
274 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
274 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
274 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
267 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
267 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
267 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
267 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
267 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
263 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
312 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6215  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  31.91 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
278 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
261 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.15 
 
 
258 aa  115  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
262 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
263 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  30.57 
 
 
291 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
291 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 
267 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.57 
 
 
291 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  29.5 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6258  transcriptional regulator, IclR family  36.41 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  29.12 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  35.78 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
267 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
319 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  31.23 
 
 
284 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
263 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3701  regulatory protein, IclR  29.71 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  29.63 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  29.63 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  33.48 
 
 
268 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  32.5 
 
 
260 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 
267 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0773  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 
275 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.424221  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
268 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
294 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0707  transcriptional regulator, IclR family  34.56 
 
 
274 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
230 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  28.96 
 
 
279 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 
274 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
263 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5918  IclR family transcriptional regulator family  34.55 
 
 
298 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
274 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
268 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  31.37 
 
 
275 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  30.27 
 
 
263 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>