More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1537 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 315 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0804  IclR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 275 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0814  IclR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 275 aa  275  8e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.91891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 274 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  28.03 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  32.37 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  31.76 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 260 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 274 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 267 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 278 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  29.84 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  32.38 
 
 		 274 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  28.14 
 
 		 267 aa  95.9  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 267 aa  95.9  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 267 aa  95.9  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 267 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 267 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 267 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 267 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 263 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  29.21 
 
 		 635 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  31.92 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 312 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 275 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 275 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  29.51 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 275 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0752  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 291 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  33.93 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 263 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  28.92 
 
 		 279 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  30.68 
 
 		 284 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  26.89 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  26.88 
 
 		 269 aa  89  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5773  transcriptional regulator, IclR family  30.14 
 
 		 263 aa  89  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.501857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  28.12 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 278 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  28.44 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 264 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  27.68 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  26.21 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 261 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  26 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  26 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  26.23 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  26.53 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  26.15 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>