More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0804 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0804  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 275 aa  566  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0814  IclR family transcriptional regulator  89.45 
 
 		 275 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.91891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1537  regulatory protein, IclR  51.12 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2596  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.800266  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1055  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0221  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4239  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2225  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0093457  normal  0.42104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0267  IclR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0022  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1745  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  0.0427002 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0004  regulatory proteins, IclR  33.82 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.915259 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3554  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  31.9 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0227  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.580267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2437  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.404783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1596  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1134  regulatory proteins, IclR  32.1 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3170  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0777  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3903  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  27.37 
 
 		 280 aa  98.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7075  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3214  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0806  IclR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1818  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  0.0123424 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  30.33 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3880  regulatory protein, IclR  28.74 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2652  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  28.57 
 
 		 635 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4732  IclR family transcriptional regulator family  33.64 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0612254  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  32.43 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 274 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  26.21 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0814  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  31.44 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4014  regulatory proteins, IclR  30.63 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  hitchhiker  0.00571873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3907  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  30.13 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  25.74 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  25.74 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  30.13 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0111  regulatory proteins, IclR  27.49 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  28.08 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7316  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0754  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0128  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.812702  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  30.97 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7626  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182357  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0757  putative transcription regulator protein  32.03 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.702706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4339  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.91 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0691  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01930  transcriptional regulator PcaR  27.39 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.676687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>