More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3080 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  57.54 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  51.15 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  47.58 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  45.86 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  46.64 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 280 aa  178  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  39.04 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  37.85 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  37.86 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  34.23 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  34.35 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  34.9 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  33.81 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  34.06 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  35.48 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  36.51 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  31.93 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  36.48 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  29.41 
 
 		 255 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  33.48 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 249 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  32.61 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  30.13 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  31.84 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  31.2 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  31.09 
 
 		 241 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  31.89 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  27.51 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  33.61 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  30 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.69 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8163  transcriptional regulator IclR family  33.16 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0684047  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  28.04 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  28.5 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1720  IclR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.078554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  26.46 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.79 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  26.27 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>