252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1720 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1720  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.078554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  71.67 
 
 		 247 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  42.19 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  37.55 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  31.47 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  32.51 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  27.69 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  29.23 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  30.71 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  30.61 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  30.12 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  30.61 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  30.25 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  32.21 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  31.18 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  24.79 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  33.19 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3614  transcriptional regulator, IclR family  32.76 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.149687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  33.33 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.37 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  24.37 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  24.37 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  24.37 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  24.37 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  32.52 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  24.37 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  26.25 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  24.37 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  25.13 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  25.13 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  25.13 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  25.13 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  25.13 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0496  regulatory protein, IclR  34.95 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  26.42 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  27.1 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  23.35 
 
 		 263 aa  52.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 249 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  28.45 
 
 		 266 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  28.45 
 
 		 266 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  27.59 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  24.55 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.51 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  28.45 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  25.23 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  28.45 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  27.59 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  28.45 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.54 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7484  IclR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  33.02 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  37.14 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8160  transcriptional regulator, IclR family  38.75 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.48 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  26.45 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 268 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>