More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4127 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  547  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  38.14 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  34.59 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  36.25 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  31.92 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  32.35 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  35.34 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  34.68 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  36.67 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  32.64 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 280 aa  125  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  34.21 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  35.34 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  33.2 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  28.8 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  32.08 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  33.6 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  37.84 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  32.06 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  30.93 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  28.46 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 251 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 		 252 aa  93.2  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  28.63 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  30.19 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  27.64 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  29.8 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  31.03 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  27.12 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  27.87 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  25.5 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  26 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  25.31 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  28.91 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  29.54 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  26.27 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  26.45 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4108  transcriptional regulator, IclR family  31.49 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  22.53 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.39 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>