More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2470 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8163  transcriptional regulator IclR family  56.79 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0684047  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  31.55 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  28.09 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 295 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  28.94 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  27.23 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 304 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 273 aa  89  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  27.51 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  26.67 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  26.7 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  25.51 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  26.05 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  27.54 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  27.37 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  25 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.08 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  21.61 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  24.58 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  23.18 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  27.5 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3604  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83328  normal  0.323087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  28.85 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  23.55 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  23.31 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  26.74 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  23.11 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  23.11 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  23.11 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  23.11 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  23.11 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  20.66 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  23.11 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  23.11 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  23.11 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  23.85 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  26.79 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  22.22 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  22.22 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  22.22 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  22.22 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  22.22 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  22.88 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  30.39 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  27.12 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  22.13 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  22.13 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  22.13 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  26.16 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  22.46 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  25.67 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  23.79 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>