More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4820 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 279 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  77.06 
 
 		 268 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  68.46 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  36.12 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  34.73 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  35.46 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  36.78 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  34.57 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  31.8 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  28.46 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  33.61 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  32.1 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  33.76 
 
 		 285 aa  99.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 257 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  32.58 
 
 		 279 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  30.42 
 
 		 289 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 281 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  32.34 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  27.9 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  30.77 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  31.74 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  28.09 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  35.25 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  31.72 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  31.47 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.75 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  27.08 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  32.67 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  29.88 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  27.85 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  26.78 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.69 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  27.31 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1720  IclR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.078554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4464  regulatory protein, IclR  27.76 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  29.73 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  27 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  27.71 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 601 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  27.66 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  28.21 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  27.47 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  28.1 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  26.61 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>