More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0796 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  524  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  77.06 
 
 		 279 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  64.93 
 
 		 268 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  36.89 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  31.38 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  35.54 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  32.64 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  32.64 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  31.47 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  31.14 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  26.09 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 279 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  28.97 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 301 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  32.74 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 		 263 aa  89  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  30.95 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  30.13 
 
 		 284 aa  85.9  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  31.36 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  29.06 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0258  IclR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2216  regulatory proteins, IclR  30.7 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108456  normal  0.474426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  31 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  27.59 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  30.34 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20110  transcriptional regulator  31.84 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  27.35 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  35.17 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  26.97 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  29.74 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2267  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2838  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 601 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  27.95 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1626  IclR-type transcriptional regulator  28.46 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4310  Pca regulon regulatory protein PcaR  27.75 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  27.97 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  32.16 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2788  transcriptional regulator, IclR family  30.13 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  27.85 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  26.5 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  30.15 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>