More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0309 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 286 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  88.04 
 
 		 304 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  80.23 
 
 		 288 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  74.9 
 
 		 295 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  73.76 
 
 		 292 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  74.14 
 
 		 300 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  74.9 
 
 		 295 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  74.14 
 
 		 300 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  70.21 
 
 		 292 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  72.69 
 
 		 281 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  72.12 
 
 		 292 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  73.54 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  72.76 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  71.37 
 
 		 275 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  52.85 
 
 		 276 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  58.09 
 
 		 272 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  41.8 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 270 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  37.05 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 301 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  38.37 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  36.82 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  33.98 
 
 		 266 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  34.31 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  35.37 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  35.19 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 257 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  28.87 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  33.78 
 
 		 253 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  36.59 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 249 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 249 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  33.62 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  34.4 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  32.61 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 252 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.27 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  28.34 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  28.8 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  30.57 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  26.94 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 255 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 255 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 253 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  30.36 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.44 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.39 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  32.95 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  27.97 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  26.75 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5543  regulatory protein, IclR  29.73 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.452687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  27.34 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>