More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2805 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  100 
 
 		 302 aa  577  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  57.54 
 
 		 281 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  54.58 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  52.44 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  46.69 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  53.09 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 280 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  41.88 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  42.41 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  41.37 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 270 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 273 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  37.35 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  34.38 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  36.64 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  35.52 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  37.04 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  39.51 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  34.8 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  37.73 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  32.68 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  36.06 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  33.06 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 249 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  31.91 
 
 		 271 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0905  regulatory proteins, IclR  35.25 
 
 		 241 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.712353  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  28.51 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  28.46 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5383  IclR family transcriptional regulator family  35.6 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 		 279 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 252 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 261 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0796  IclR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2470  regulatory protein IclR  29.38 
 
 		 251 aa  85.9  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  24.9 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1684  transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0925752  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  31.48 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  27.64 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  30.63 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3857  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32.03 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  25.2 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0378  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105767  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  29.22 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>