More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3971 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  98.62 
 
 		 289 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3889  IclR family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 272 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  48.58 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  47.56 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4007  regulatory proteins, IclR  42.74 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.556635  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  37.32 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3080  transcriptional regulator, IclR family  33.81 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2369  IclR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2336  regulatory proteins, IclR  36.44 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477637  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  36.05 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2805  regulatory protein IclR  39.41 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1440  regulatory protein IclR  33.08 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  hitchhiker  0.00000381695 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  32.55 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3613  IclR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6503  IclR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  35.15 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6282  regulatory protein, IclR  34.8 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  33.78 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  29.88 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0650  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8145  transcriptional regulator IclR family  35.37 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.122254  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  29.76 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4818  regulatory proteins, IclR  38.31 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.189718  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6076  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3646  regulatory proteins, IclR  32.52 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.146273 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6293  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4262  IclR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 249 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  29.28 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0840  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0889831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  32.27 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  27.93 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 255 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.97 
 
 		 252 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4574  IclR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0696248  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  32.84 
 
 		 251 aa  85.9  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  27.03 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  30.59 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  29.2 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4820  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  32.52 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.48 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4402  regulatory proteins, IclR  33.48 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8178  Transcriptional regulator  27.23 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0652  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  27.53 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  32.47 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0811  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1774  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  26.4 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  26.4 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  26.4 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  31.92 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  29.41 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>